Diferença chave: Shia é uma das duas principais seitas do Islã, a outra sendo sunita. Ismaili é uma divisão dentro da seita xiita. A divisão é devida à seleção de um imã.
Antes de entender como os xiitas se dividem nesses três ramos, é importante entender como as diferenças entre os sunitas e os xiitas foram formadas. Sob Maomé, todos os muçulmanos foram considerados como um. Maomé é considerado o profeta final de Deus. As diferenças seguiram a morte de Maomé. Maomé morreu sem declarar oficialmente um herdeiro para liderar a comunidade muçulmana. Havia dois candidatos principais: Abu Bakr (sogro de Maomé) e Ali (primo de Muhammad e genro). Os sunitas escolheram Abu Bakr, que era amigo e confidente de Muhammad como califa para liderar e aconselhar. No entanto, os xiitas acreditavam que o Califado deveria permanecer dentro da família de Maomé e, portanto, preferiam Ali como o líder. Ali se tornou o quarto califado sob o governo sunita. Além dessas, existem outras pequenas diferenças em relação a como elas oram e em que acreditam. Por causa dessas diferenças entre os xiitas e os sunitas, houve um confronto constante entre as duas seitas do islamismo.
Os xiitas também enfrentaram alguns desacordos internos em relação aos imãs e que deveriam liderar como imã. Sob o islamismo xiita, um imã é considerado um líder que é considerado uma orientação para todas as facetas da vida. De acordo com a doutrina xiita, o Imamah é uma instituição divina que sucedeu a instituição da profecia. Eles acreditam que os Imams são selecionados e escolhidos por seres divinos, eles têm conhecimento completo e podem corretamente interpretar o Alcorão. Agora, a diferença entre os xiitas é diferente por causa da seleção de imãs. Ismaili é um ramo do islamismo xiita que tem o nome de Ismail ibn Ja'far, que eles acreditam ser o Imam nomeado por direito ou o sucessor espiritual. Isso difere dos Twelvers que acreditam em Mūsà al-Kāżim, irmão mais novo de Ismail, como o verdadeiro Imame.
O ismaelismo, em um ponto, foi o maior ramo de Shisim que esteve em poder político durante os séculos X e XII. Desde então, o ismalismo é um ramo e uma parte dos xiitas, ambos compartilham muitas crenças, incluindo que existe apenas um único Deus verdadeiro e que os imãs devem ser os descendentes de Maomé através de sua filha, Fátima. Ambos, xiitas e ismaelitas acreditam que a família de Muhammad (Ahl al-Bayt) foi divinamente escolhida, infalível e guiada por Deus para liderar a comunidade islâmica.
O Nizari Ismaili é um caminho (tariqah) do islamismo xiita, enfatizando a justiça social, o pluralismo e a razão humana dentro da estrutura da tradição mística do Islã. É considerado o segundo maior ramo do Islã e forma a maioria dos ismaelitas. O Mustaali Ismaili é uma seita do ismaelismo xiita. A principal diferença entre o Nizari Ismaili e Mustaali Ismaili é quem deveria ter liderado como o Imam. Os Nizaris aceitaram Imam Nizar (o primeiro) como o décimo nono imame, enquanto os Mustaalis consideram o irmão mais novo de Nizar, Mustali. Os muçulmanos Nizari são atualmente chefiados por Aga Khan IV, que é conhecido como Imam Shah Karim.
Segundo a Wikipedia, “Os Musta'liyyah são também referidos como os Taiyabi ou Ṭayyibī, depois do último Imām que eles reconhecem, Ṭayyib Abī l-Qāṣim. Historicamente, havia uma distinção entre o Ṭayyibiyyah e o Ḥāfiziyyah, este último reconhecendo os governantes fatímidas do Egito (entre 1130–1169) como Imans legítimos, e não Ṭayyib Abī l-Qāṣim. A visão Hafizi perdeu todo apoio após a queda da dinastia fatímida: os Musta'liyya atuais são todos Ṭayyibiyyah. O maior grupo Mustaali é o Bohra, e o maior grupo de Bohra é o Dawoodi Bohra, encontrado principalmente na Índia. O nome Bohra é uma reinterpretação da palavra ghajarati vahaurau ("comercializar"). O povo de Bohrā compreende dois grupos principais: a maior parte da classe de comerciantes Shīʿī e uma minoria sunita que são principalmente camponeses. ”
Os xiitas e os ismaelitas são bastante semelhantes em suas crenças e culturas, pois os ismaelitas fazem parte da seita xiita. Todas as seitas compartilham a mesma crença em relação a Alá e Maomé. Acredita-se que Deus é o único e verdadeiro Deus, com Maomé sendo o último profeta de Deus.